مختبرات المركز مجهزة لتنفيذ جميع الفحوصات المخبرية الحسية والكيميائية و الميكروبيولوجيةو الفيزيائية للمنتجات الغذائية و مياه الشرب وزيت الزيتون مثل النشاط المائي و نسبة الرطوبة و كمية الطاقة و نسب البروتين و الدهون و الكربوهيدرات و الرماد و الفيتامينات و المعادن و المواد المضافة و نسب الملوثات و العدد الكلي للبكتيريا و الخمائر و الاعفان و بكتيريا القولون و البكتيريا المرضية و السموم و العيوب و الشوائب و اللزوجة و الكثافة و معامل الانكسار و غيرها من الفحوصات التي تحددها المواصفات القياسية للمنتجات .